肛门有肿物，排便时有疼痛，需要先到肛肠科进行就诊，通过肛门局部的检查明确诊断。在诊断明确之后，是通过药物治疗或者是进行手术的治疗。

肛门有肿物排便时疼痛，首先是考虑有痔疮的存在，痔疮当中的外痔可以发生脱出，脱出以后回纳不及时会出现疼痛。痔疮当中的外痔如果有水肿、血栓发炎，也会出现排便时的疼痛。

另外，就是排除是不是有肛门周围脓肿等，感染性的疾病存在，是由于肛门周围的软组织在受到细菌感染等因素的影响下，出现了坏死、液化。最后有脓液的形成，在排便时受到粪便的刺激，就会出现疼痛的症状。

肛周脓肿是属于感染性的疾病，需要通过手术进行治疗。如果是由于痔疮的因素，主要还是通过药物治疗为主。