慢性反流性肾病的治疗方法分为一般治疗和特殊治疗。一般治疗是指患者要注意个人卫生，要多饮水，要定期排空膀胱，以减轻膀胱内压力，以及减少膀胱残余尿量。

特殊治疗就是要针对患者的临床表现，进行相应的治疗，由于反流性肾病患者容易出现尿频、尿急、尿痛，必须使用抗生素治疗。治疗2周以后，再改用长疗程、低剂量抑菌疗法作为预防性的用药，减少感染就是保护肾功能一个非常重要的措施。

对慢性反流性肾病患者的高血压要严格的管理，可以使用血管紧张素转化酶抑制剂或者钙离子通道阻滞剂进行血压控制。如果适合进行手术治疗的慢性反流性肾病患者，应该积极的进行手术治疗。