临床有证据证实胃酸的反流可能会引起食管癌的发生，考虑原因是由于胃酸反流导致食管黏膜长期受到酸液的刺激导致黏膜损伤，从而引起经久不愈的食管慢性炎症，使得食管的上皮细胞处于一种发育不良的状态，这种发育不良的状态属于食管癌的癌前病变。

发育不良的食管黏膜又受到外界致癌因素的长期的刺激，导致上皮组织从慢性炎症逐渐发生不典型的增生。然后成为重度不典型增生，最终演变发展成为食管癌。

食管癌一旦发生，则其预后情况较差。