基底凹陷症一般主要是由于先天发育畸形有关，但也有一部分患者是由于外伤引起的。常见的临床表现或者早期的临床表现，主要是以存在头痛或者出现肢体运动障碍、感觉障碍。随着疾病的进展，有可能会表现为严重的呼吸功能抑制或者呼吸困难，甚至有可能会引起睡眠障碍。

如果有必要的情况下，可以及时完善头颅核磁检查，一般主要可以发现头颅脑神经发育异常，有的一部分患者存在小脑扁桃体下疝畸形，甚至存在脊髓空洞的情况。建议需要及时到二甲以上医院神经外科进行治疗的。