保留灌肠和不保留灌肠的区别主要是治疗方法以及对症疾病不相同。保留灌肠一般是将药物灌入直肠内，药物通过直肠粘膜的吸收，从而达到治疗的效果。保留灌肠可以用于治疗结直肠炎，妇科的炎症，比如子宫附件的炎症、盆腔炎，还有男性的前列腺炎等等一些疾病。而不保留灌肠主要是用于治疗便秘、缓解急性的便秘症状。可以采用温肥皂水100到200毫升进行低压灌肠，或者用于肛肠手术前的肠道准备，称之为清洁灌肠，也是先使用肥皂水，然后使用生理盐水灌肠、清洁肠道。