畸形性吞咽困难可能会因为食管长期受压引起的食管癌。食管癌早期症状轻而不明显，症状为吞咽梗阻、食欲不振、胸骨不适、灼痛。下食管癌患者也会在剑突或上腹部造成不适、呃逆和打嗝。

当病情发展到中晚期时，患者出现声嘶、吞咽困难、食物反流、肩胛背或胸骨持续隐痛、呕血或大便发黑等症状。虽然在这段时间内病情会加重或减轻，但总的趋势是不断加重。

晚期患者会出现体质差、脱水、黄疸、腹水、气管压迫所致呼吸困难、声带麻痹、昏迷等症状，并伴有水电解质紊乱。