畸形性吞咽困难是由某些器官的畸形引起的，即右锁骨下动脉发育及其走行异常引起的吞咽困难，称为异常吞咽困难。病人的早期主要表现是吞咽困难，如果食道因畸形而压迫，主要会食道吞咽困难。如果血管畸形压迫气管，可能引起呼吸困难。

对病情轻、吞咽困难轻的患者进行随访观察。如果病情比较严重，影响患者的日常生活，甚至影响其营养摄入，都会进行手术。手术方式取决于患者的血管畸形或发育畸形，患者需行血管外科治疗，明确诊断后再进一步诊治。