一般肝脓肿是不会留下后遗症的，多数的患者恢复的相当好。但是肝脓肿比较严重、或者抵抗力比较弱、或者本身肝脏就存在疾病，有可能会导致肝脏的纤维化或者肝脏的囊肿，或者导致肝功能的下降等，一般不会留下比较严重的后遗症。

但是对于肝脓肿的患者恢复以后，也应该进行复查，确定患者的恢复情况。特别是抵抗力比较弱，以及有基础疾病的患者，要积极的检查，提高自己的抵抗力，并且判断是否留有后遗症。