低头时后背肩胛骨会疼，主要是因为肩胛骨部位存在很多的肌肉，长时间低头会使肩胛骨周围的肌肉、筋膜以及颈椎后侧的韧带遭受牵拉。

而颈部与后背由肌肉相连接，所以就会出现后背以及肩胛骨疼痛，在临床上常见于肩背部筋膜炎；患者可通过使用肌肉松弛剂以及抗炎镇痛药物予以治疗，可改善疼痛症状；同时可针对局部进行热敷、按摩等理疗，并外敷活血止痛的药膏，可改善临床症状，减轻疼痛。

在治疗期间，患者应避免长时间低头、久坐，注意做好颈肩部的保暖工作。