预防巧克力囊肿复发，可以用下列方法：

第一，如果是已婚的女性可以考虑在宫腔内上入高效孕激素的节育环进行治疗，因为这种节育环可以使子宫内膜萎缩，同时也能使异位症的病灶出现萎缩，所以就达到了预防复发的目的。这种节育环的有效期是五年，五年之后可以考虑在更换新的节育环达到继续治疗的目的。

第二，临床上可以注射醋酸曲普瑞林进行治疗，在临床上造成假绝经的现象，所以能够使子宫内膜出现萎缩。在临床上也能预防巧克力囊肿的复发，并且建议巧克力囊肿在手术之后要定期复查。