巧克力囊肿如果出现复发，是比较常见的现象，主要的治疗方法要根据病人是否有生育要求决定。

如果有生育要求，在做完手术以后，可以应用3个月抑制卵巢功能的药物，停药以后尽快进行备孕。如果备孕超过1年，仍然没有怀孕，可能是盆腔粘连造成的，下一步最好做试管婴儿。

如果没有生育要求，做完了巧克力囊肿手术以后，宫腔内可以放置左炔诺孕酮宫内缓释系统，这是一种释放孕激素的环，可以抑制巧克力囊肿复发。