输精管疼痛考虑是输精管炎症、附属腺结核、附属腺炎症等原因引起。

当输精管局部发生急慢性的炎症时，例如慢性输精管炎、急性输精管炎，由于炎症的刺激，导致输精管壁组织受到刺激引起疼痛，可能引起输精管壁增厚，引起输精管堵塞。附属腺结核，例如输精管结核、附睾结核，由于感染了结核杆菌也可引起输精管疼痛。

附属腺发生炎症时，例如精囊炎、附睾炎、前列腺炎，由于炎症刺激局部的组织，导致充血、水肿，可引起牵涉痛，导致输精管发生疼痛。需要前往泌尿外科完善相关的检查才可以确诊，再给予对症止痛治疗。