输精管疼痛有可能是输精管炎，也可能是输精管结核或者肿瘤引起的。

输精管出现疼痛比较常见的输精管炎，大多数因为前列腺炎没有注意控制，病原体逆行感染，到达附睾、睾丸，进入到输精管，引起炎症性的反应。从而引起输精管局部出现充血、肿胀、疼痛，通常会伴有射精疼痛，严重的可出现排血精。

有可能是输精管结核或者肿瘤引起的，需要完善检查确诊病因后对症治疗，避免病情严重，导致输精管堵塞，影响男性的生育。