患上肛瘘后服用抗生素治疗，可暂时减轻肛瘘的炎症，但不能治愈肛瘘。

肛瘘是由内溃口、外溃口以及皮下瘘管三部分组成的，内溃口位于齿状线的肛隐窝处，容易受到粪便内细菌的入侵，感染形成化脓性炎症，脓液会通过瘘管扩散，引起瘘管周围的软组织肿胀、疼痛。当脓液冲破外溃口，从外溃口流出后，炎症会慢慢消退，反复发作，迁延不愈。

当肛瘘发作后，服用抗生素可暂时缓解肛瘘的炎症，停用抗生素后肛瘘又可出现化脓性炎症，手术是治愈肛瘘唯一的有效的方法。