肛瘘瘘管堵塞需要手术。当肛瘘瘘管堵塞，瘘管内出现感染时就会导致患者出现剧烈的疼痛，会表现为类似于肛周脓肿的临床症状。

此时，患者就需要通过手术将堵塞的肛瘘瘘管切开，使脓液可以引流通畅，可以迅速缓解局部的疼痛症状。局部已经形成肛周脓肿的患者也需要行肛周脓肿一次性根治手术，并且配合使用抗生素，控制局部的感染。

对于肛瘘无论其瘘管是否堵塞，均需要通过手术治疗才能完全治愈，所以，建议肛瘘患者及时去医院行手术治疗。