射精后阴茎部位发生的轻微疼痛，可能跟阴茎损伤、患有阴茎硬结、尿道感染等疾病有关。

性体位选择不当或者是性过程中动作过猛，容易引起阴茎损伤性疼痛。患有阴茎硬结未采取有效的治疗，阴茎在性过程中摩擦可引起疼痛。患有尿道炎高潮射精时进一步加重对充血、水肿黏膜的刺激，引起射精后阴茎疼痛。

暂停同房轻微的损伤可自行修复，疼痛感即可消失。一般明确阴茎硬结引起的射精后疼痛可给予局部理疗，过大的阴茎硬结可考虑行手术治疗。