射精后阴茎痛，一般和性生活时用力过大引起阴茎损伤有关，会伴随着明显的阴茎肿胀、疼痛现象。

另外，射精后阴茎疼还与阴茎海绵体极度水肿有关。例如阴茎静脉炎或者阴茎海绵体炎症，就会引起阴茎海绵体水肿。

其次，射精后阴茎疼痛，还与尿道堵塞或者尿道狭窄有关，因为在这种情况下精液不能正常排出尿道口，射精时精液会压迫尿道狭窄处，从而引起阴茎疼痛。为了明确具体病因，建议做阴茎超声检查和尿道超声检查确诊。