早上起来喉咙不舒服一直咳嗽，可能与咽炎有关。如果是继发上呼吸道感染所致，在合并细菌感染的情况下，可以应用阿莫西林、头孢克肟等药物治疗，也可以适当服用板蓝根颗粒治疗。

这种情况也可能是气道敏感引起的过敏性咽炎，需要应用盐酸西替利嗪、孟鲁司特钠等药物治疗，也可以配合应用止咳药物，比如苏黄止咳胶囊等。

也不排除与反流性食管炎有关，治疗的根本在于原发病，需要应用奥美拉唑等质子泵抑制剂，同时搭配促进胃动力的药物，比如多潘立酮片等。除了药物治疗外，饮食上要避免吃辛辣刺激性的食物，同时多喝水。