治疗巧克力囊肿时是可以正常性生活，只不过有可能会影响怀孕，而且过性生活对这个疾病还有一定的好处，因为巧克力囊肿实际上是因为内分泌不调而引起，性生活对内分泌是有好处。

巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种病变，虽然是良性疾病，却有增生、浸润、转移及复发等恶性行为，它的临床表现为痛经进行性加重、性交疼痛、不孕及月经失调等。

如经确诊应尽早积极对症治疗，巧克力囊肿的患者饮食宜清淡，多食用富含营养的食品，不易常食刺激性食物、海产品等。