脑血栓发生腿痛，主要原因包括两方面：

第一，有考虑是由于脑血栓导致中枢神经系统损害，引起出现脑神经细胞损伤，导致肌张力障碍引起的临床症状。这种情况可以在医师指导下，应用加巴喷丁或丙戊酸钠进行治疗。

第二，是由于脑血栓后遗症引起肢体活动异常导致的肌肉疼痛，可以在医师指导下进行康复理疗和止痛药物进行治疗，但上述治疗办法只是改善临床症状，并不能从根本上解决问题。最主要的还是需要避免脑血管疾病反复，需要严格控制好血压、血脂、血糖，戒烟戒酒，运动减肥，定期复查脑神经系统功能。