肛门疼痛有便意，可能是以下一些疾病引发：

首先，有可能是肛窦炎或者肛管炎，这两种疾病会引发肛门疼痛症状，但疼痛不会很剧烈，也会刺激肛管产生频繁的便意感。

其次，肛周脓肿。主要是高位的肛周脓肿会表现为肛门局部胀痛，脓腔刺激直肠会引发便意感，并且会伴有发热、畏寒、寒战等全身症状。

第三，痔疮，当痔疮出现急性发作时，也会表现为疼痛症状，并且肿大的痔疮会刺激患者而产生便意感。

所以患者需要及时去医院就诊，明确肛门疼痛和便意感的原因，再针对病因采取相应的治疗。