舌头根部一动就疼可能跟以下原因有关：

1.创伤。舌头根部受到创伤会引起疼痛。如果最近吃了过烫或过硬的食物，都可能会引起舌头根部的创伤。

2.感染。在人体免疫能力低下的时候，细菌、病毒等病原微生物进入体内，可能会导致舌头根部一动就疼，临床上常见致病微生物是单纯疱疹病毒。

3.肿瘤。舌头根部是肿瘤的好发部位。如果患有肿瘤性疾病会导致舌头活动受限，引起舌根部位的疼痛。

建议尽快去医院的口腔科就诊，配合医生完善相关检查，找到引起舌头根部一动就疼的具体原因。