直肠黏膜脱垂可以通过药物治疗或手术治疗。直肠黏膜脱垂可发病于任何年龄，幼儿和经产妇以及年老体弱的患者比较容易患此病。

如果是5岁以内的幼儿直肠脱垂，随着年龄的增长可以自愈。可通过保守治疗，可将脱垂的直肠黏膜推入直肠内，用纱布堵住肛门，并用胶带固定。也可进行注射疗法，将消痔灵注射到直肠黏膜，促进黏膜与肌层粘连固定。

成年人轻症的直肠黏膜脱垂，可以服用补中益气的中药调理，也可以进行硬化剂注射治疗。如果严重的直肠黏膜脱垂需要考虑做手术切除治疗。