毛霉菌病发作后，症状主要包括创面呈现棉絮状的真菌病灶。

随着病情的进展，病灶会不断蔓延到深层组织，可累及肾脏、肺部、皮肤、胃肠道。患者可出现不同程度咳血、呼吸困难、胸痛等表现。若累及肺部，可出现高热或低热。

其次，还有可能伴随咳嗽、咳痰、呼吸频率加快等表现。同时还会伴随梗塞、血栓形成等征象。若病变累及肺动脉，可出现危及生命的大咳血现象。此时双肺有胸膜摩擦音及广泛湿啰音，这种疾病可表现为进展性，死亡率非常高，3~30天内即可发生死亡。