肛瘘动手术之后有可能会出现复发，不同类型的肛瘘复发概率也不相同。

例如一些低位单纯性的肛瘘，其复发概率非常低，一般低于5%。而对于一些高位复杂性的肛瘘，术后复发的概率就比较高，可达到15%~20%。

肛瘘手术后出现复发，主要是在手术中遗漏了瘘管或者内口的处理。所以为了降低手术后的复发率，患者在手术前需要完善一些术前的检查，例如瘘管造影、磁共振、腔内超声等，明确瘘管的走行、数量以及内口的位置和数量，充分做好术前评估，才能降低术后的复发率。