如果患者的肩膀肌腱出现损伤，是否能够自愈，主要取决于患者的损伤程度。

如果患者的肩膀肌腱损伤以后，只是出现了轻微的充血、水肿，或者是只有少部分的纤维撕裂，这时候通过对肩关节部位进行制动处理，一般制动三周左右以后就可以恢复了。

但是如果患者的肌腱损伤比较严重，出现了明显的肌腱断裂的情况，就会导致患者的肩膀出现明显的疼痛，甚至出现活动受限等情况。这种情况肌腱损伤是不能够自愈的，就需要患者去正规医院进行检查及手术的治疗，通过手术以及后期的功能锻炼，患者的肩关节才会逐渐恢复正常。