感染尼帕病毒一般不会出现腹泻的表现。

这种疾病的临床表现主要为严重性头痛、发热、肌肉酸痛、脑脊膜炎等。多数人感染尼帕病毒后，潜伏期的时间大约持续1~3周，在发病时主要表现为发热、头痛、倦怠、无力。随着病情逐渐加重，可能会出现嗜睡、反应力减退、定向力减弱等表现。严重者可能会出现昏迷，昏迷时间过长的病人会有永久性脑损伤。

少数病患可能会出现呼吸道表现，也有可能会出现加速血压增高等病情，需要及时进行诊治。