查加斯病的预防首先要改善住所，消灭锥蝽栖息地。住房内及其外周定期喷洒杀锥蝽药物，以便控制传播媒介。

建立良好的卫生习惯，晚间将所有动物特别是犬从住房中驱除出去。并尽量消灭动物贮存宿主，孕妇应加强锥蝽的检查，药物治疗急性早期与不定期孕妇患者和他们的新生儿。供血员于供血前应用血清学方法检测抗体，筛除感染。将有感染的血液于使用前加结晶紫置于4度电冰箱内24小时杀灭锥蝽，才可安全使用。