查加斯病的治疗首先要进行饮食习惯的调整，为缓解症状，可指导病人进行饮食调整，如细嚼慢咽、进食流质及软食，或在进食固体食物的同时进食流质饮食，注意避免进食过热及过冷的食物。

另外可以给予一些药物进行治疗，包括硝酸异山梨酯等药物。

另外还可以给予有创性的治疗，主要是应用机械的方法来改善其功能性梗阻症状，即通过使用气囊等方法扩张食管远端。

少数病人在机械方法不能改善临床症状，需要进行肌层切开术或食管切除、颈部胃食管或者食管空肠、食管结肠吻合术。