早上起床吐血痰的原因可能与肺结核、肺部肿瘤等疾病有关，也可能与牙龈出血等有关。

肺部的疾病主要包括肺结核、支气管扩张、肺部肿瘤等疾病，这些疾病导致的血痰出现时间并不局限于晨起，也可能在其他的各个时间段出现。通过肺部的CT、肿瘤标志物检查，以及痰检可以明确诊断。

由于牙周炎、牙根炎，以及牙龈炎等口腔疾病在临床中容易出现出血，所以也会表现为早晨起床后咳出血痰，通过口腔检查，发现牙龈出血，即可明确诊断。