怀孕50天不可以做药流。

因为在怀孕50天时孕囊比较大，使用药物流产可能会导致不全流产，孕囊无法排出干净，也会使出血较多，严重时甚至会导致大出血，可能需要再次清宫，会对女性的生殖系统造成危害，因此在50天时尽量不要做药流。

药流的最佳时间为49天以内，在进行药物流产时也要注意观察。如果流血已经超过了7天，出血量没有减少或者没有看到孕囊排出来，应就医进行详细的B超检查，确定宫腔内是否有残留物。如果存在残留物，还应进行清宫手术。