小腿肌肉萎缩可以有以下几种原因：

1.由于中枢神经系统受损而导致肌肉萎缩，比如脑出血、脑梗塞后遗症、偏瘫就可以出现小腿肌肉的萎缩。

2.由于周围神经系统受损，比如腰间盘突出压迫神经。如果神经损伤严重可以导致小腿肌肉萎缩，或者是支配小腿肌肉的神经受到了损伤，也可以出现小腿肌肉的萎缩。这时要根据病因给予治疗，及早解除对神经的压迫。

3.由于废用性萎缩而导致，这是在小腿骨折之后由于长时间的制动而导致肌肉废用性的萎缩，这种萎缩可以通过伤后的功能锻炼逐步地恢复正常。

所以小腿的肌肉萎缩要查明原因，根据原因给予相应的治疗。