右侧卵巢巧克力囊肿是否严重，需要根据囊肿的大小以及囊肿是否发生感染，或者出现严重痛经等症状而定。

卵巢巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种，是子宫内膜移位到卵巢后形成，属于一种良性肿瘤。如果囊肿比较小，没有对卵巢功能产生不良影响，而且没有出现明显的痛经症状，病情就不是太严重，也不需要特殊处理。

随着囊肿逐渐长大，当囊肿超过5cm以上，逐渐出现剧烈痛经症状，甚至影响了卵巢功能，引起卵巢内分泌紊乱，导致月经失调后，说明巧克力囊肿病情就比较严重，需要尽早手术治疗。