肛门闭锁在临床上都需要行手术治疗才能治愈。

虽然目前肛门成形术得到很大的改良，还有腹腔镜的辅助，但是术后仍然存在着一些后遗症。最主要的就是肠道功能紊乱，慢性便秘以及肛门失禁等。这些都属于术后排便功能的障碍。对于术后排便功能障碍的防治，可以通过肠道管理、调整饮食、排便训练、药物治疗、灌肠、心理行为治疗、生物反馈治疗，甚至手术治疗来调整和治疗，大多都能够获得满意的治疗效果。