直肠闭锁并非就是肛门闭锁。准确地说，直肠闭锁和肛门闭锁发生的部位并不相同，但两者是属于同一类疾病，都是由于先天发育异常所引发的肛门直肠疾病。

肛门闭锁患者闭锁位置是位于肛管，观察患者的会阴部，并看不到正常的肛门呈闭合状态。而直肠闭锁其闭锁位置是位于直肠，患者有可能可以在会阴区看到正常的肛门，但肛门与腹腔内的肠道并不相通，在直肠部位是处于闭合状态。

当然两者也有可能同时存在，就是直肠闭锁与肛门闭锁同时存在。无论是直肠闭锁，还是肛门闭锁，均需要通过手术治疗才能治愈。