首先肛门闭锁是一种肛门直肠先天性畸形，对于先天肛门闭锁其发病原因目前认为与遗传因素有一定关系，同时与妊娠早期病毒感染、化学物质、环境及营养物质也有一定的关系，所以先天性肛门闭锁是会发生遗传的。在临床上根据肛门闭锁的位置不同，可以将其分为高位闭锁、中位闭锁和低位闭锁。一般认为x线平片上的耻骨线相当于耻骨直肠肌平面，以此区分高位、中位与低位闭锁。