在临床上发现，先天性精囊囊肿的年龄不一，通常大多数病人是在20到40岁时出现临床症状才发现。在临床上如果囊肿的直径小于5厘米时，可以没有任何症状，常因腹部的包块或者是直肠指诊时在前列腺的上方触及到肿块而被发现。如果是在性和升值成熟或者是性活跃期时，患者可以出现为排尿的刺激症状、梗阻症状或者是与慢性附睾炎、前列腺炎相关的症状，包括腹部、会阴部、骨盆疼痛，射精痛、尿痛、尿频、血尿、尿路感染等，有的患者也可以出现其他的一些情况，如不育、血精，但是有极少数的人可以表现为遗尿。当精囊的囊肿直径大于12厘米，是成为巨大的囊肿，这时存在着压迫的症状，可以表现为膀胱和直肠的梗阻情况。