深夜如果咳嗽得特别厉害，可以明确造成咳嗽的原因后，对症处理。

首先，如果是因为深夜冷空气不断在呼吸的过程中进入喉咙，导致咽喉刺激引发的严重的咳嗽，可以适当地打开家中的空调等设备，提高室内空气的温度，进行改善。

其次，如果是深夜睡觉的过程中张嘴呼吸，导致小飞虫不小心错误进入到咽喉，引发了严重的咳嗽，就要尽快地将喉部的小飞虫清理出来。

最后，如果是慢性咽炎等疾病造成的深夜的严重的咳嗽，可以通过服用咽炎片等药物缓解。