吞咽时耳根疼痛，较为常见的原因是中耳炎以及外耳道炎。

由于鼻子和耳朵之间有导管，所以吞咽时喉咙部的炎症，会顺着导管引起中耳炎，从而造成耳根疼痛。也不排除是扁桃体炎或者口腔溃疡导致，在吞咽时产生刺激，也会造成耳部疼痛。如果非炎症原因导致，则不排除为耳部外伤造成，建议患者可去正规医院进行查明。

如果外耳道出现破溃，很可能也会造成局部感染，从而出现上述症状。并且患者在患病期间不要用力吞咽，患者可适当用棉签擦拭外耳道确认是否出现流脓情况。