肛门神经性皮炎因病因不明确，没有特效的药物，治疗起来非常困难。临床上经常使用一些抗过敏的药物治疗，如口服维生素c、氯雷他定、静脉推注葡萄糖酸钙，外抹一些含有皮质类固醇类激素的药物，如曲安奈德霜等。

需要注意的是激素类药物对肛门神经性皮炎治疗效果很好，但这类药物不能长时间使用。

在神经性皮炎的瘙痒、渗出症状明显缓解后，要缓慢减至停药，以防皮肤对药物发生依赖性。