有慢性扁桃体炎是否能注射新冠疫苗，主要取决于目前病情在哪一个阶段。

慢性扁桃体炎如果目前并没有在病情发作期时，而是在稳定期，临床上也没有发热等症状，可以打新冠疫苗，不会对疫苗的效果产生影响。

但如果慢性扁桃体炎在急性发作期时，临床症状一般比较明显，甚至会导致发热症状，此时不能打新冠疫苗，否则会影响到疫苗的效果。而且在注射疫苗后本身就容易会出现不良反应，有可能会加重打疫苗后的不良反应，导致扁桃体炎更加严重。