当扁桃体发炎的时候，建议不要打新冠状病毒疫苗。

首先，扁桃体炎绝大部分是由于溶血性链球菌感染所引起的，发病后总会出现发热、咽痛、咳嗽等症状。这时候人体的免疫能力是低下的，注射新冠状病毒疫苗以后产生抗体的几率比较小。

其次，在注射新冠状病毒疫苗后，患者可能会出现一些不适的反应，例如低热、身体无力等。如果这时候伴有扁桃体炎，很难分辨是感冒引起的，还是注射疫苗所引起的。

所以建议患者在扁桃体炎治愈以后，再考虑注射新冠状病毒疫苗。