扁桃体发炎是否可以打新冠疫苗，需要根据扁桃体发炎的情况，以及患者的临床症状来判断。

如果患者属于慢性扁桃体发炎，目前病情控制得已经比较良好，患者的临床症状较少，可能仅存在扁桃体部位轻微的肿大，这种情况是可以打新冠疫苗的。

但如果患者的扁桃体炎属于急性扁桃体发炎，同时患者身体的全身性症状比较明显。例如身体已经达到高热的程度，并且有明显的精神萎靡的异常表现，这种情况就建议应当暂缓接种。