上腭长小疱可能是以下几种原因导致的：

1.鹅口疮。鹅口疮主要发生在婴儿的上腭部，在舌背部表现为有白色颗粒形成或者聚集成簇的白色斑块，对于该种疾病的治疗原则上使用碳酸氢钠清洗婴儿的口腔，然后用制菌霉素涂抹在患处进行治疗。

2.疱疹性口炎。该种疾病也会引起上腭部、嘴唇黏膜等处起白色疱疹主要发生在儿童，对于该种疾病的治疗常见的药物是口服阿昔洛韦抗病毒药，或者局部涂抹抗病毒软膏进行治疗。