巧克力囊肿是子宫内膜异位在卵巢内，随着月经周期异位的子宫内膜发生周期性出血，导致了卵巢囊肿。由于其内囊液呈巧克力样，故称为巧克力囊肿。囊肿直径小于5厘米的，可以保守治疗。给予孕三烯酮、达那唑、米非司酮等药物治疗，但是副作用很大。现在临床上对于直径小于5厘米的，只定期b超观察囊肿大小。如果直径大于5厘米或者是囊肿在短期内生长较快，那么要在腹腔镜下做囊肿切除术，术后要给达菲林药物治疗3到6个月，预防囊肿复发。