新生儿抵抗力下降，特别是早产儿，容易感染柯萨奇病毒B，建议积极防护，加强营养，感染后需要综合治疗。

新生儿柯萨奇病毒感染的潜伏期可有很大差异，一般在生后7～14天。经宫内垂直感染者多在生后5天内发病，生后感染者多在5天后发病。对疑诊或确诊新生儿CVB感染患儿均应给以有效隔离，奶具、医疗用品、生活用品均应单独清洗消毒。对症处理，如降颅压、抗感染等，干扰素是一类在同种细胞上具有广谱抗病毒活性的蛋白质，在新生儿柯萨奇病毒B感染中有一定疗效。