跑步磕到脚趾后出现肿胀应当立即停止活动，并且先用冷敷处理，立即到医院进行进一步检查和处理。

跑步如果磕到脚趾后肿胀，首先要查看局部是否有活动障碍。如果有活动障碍，暂停活动并且及时到医院进行必要的X线检查或者CT检查，除外骨折和肌腱神经损伤等情况。

如果合并有骨折，根据骨折情况必要时行切开复位内固定，术后需要石膏外固定。

如果暂时除外骨折等损伤应当限制活动，并且局部喷洒消肿止痛药物，定期根据恢复情况复查X线或CT，避免出现隐形骨折情况。