肉孢子虫病不治疗有可能自愈，但是自愈的可能性较小。

这是一种寄生虫感染所导致的疾病，主要的治疗方式是驱虫治疗，以及根据患者的临床表现，给予口服对症处理的药物，可以口服吡硅酮或者复方磺胺甲恶唑等。

具体药物的用法用量要在临床医生的指导下应用，该疾病典型的临床表现与其它寄生虫感染的典型表现大致相同，可能会出现恶心、呕吐、腹胀、腹痛、腹泻等症状，部分患者还可能会出现粘液性脓血便，在家庭护理当中要注意个人的卫生，特别是饮食卫生。