男性患者出现射精管疼痛的症状时，可能是由于发生急性射精管炎症所引起的。当射精管发生炎症时，其黏膜会出现炎性改变，可表现为炎性水肿或糜烂等。

当射精管收缩、精液通过射精管时，就会出现疼痛症状。在男性射精时最为明显，需要选择敏感抗生素积极抗炎治疗，并在未治愈前禁止进行性生活。

也可能是由于射精管狭窄或堵塞所引起的。因为这种情况下患者精液难以通过射精管排出，射精管可能会出现局部扩张，而且射精管在收缩时可能会出现痉挛，这时患者需要在明确诊断后予以手术治疗。