肝包虫囊肿疾病的症状，通常会由于寄生虫所在的部位、数量、体积，以及宿主自身抵抗力而有所区别，其导致的症状也会有所不同。

由于寄生虫生长缓慢，其症状并不是十分明显，在早期的时候，通常没有明显的症状。长期病程病人，会以意外发现腹部的包块为主要症状。寄生虫的数量多、体积大以及宿主自身抵抗力弱时，病人病情危急，需及时就医。

囊肿通常也会引起的一些并发症，例如压迫症状。后期包虫破裂，进入腹腔，可以引起腹胀、肠梗阻。进入胆道，也可以引起梗阻性的黄疸、细菌感染等。部分病人可出现过敏症状。